有机物生物化学分解基本反应可分为两大类：

水解反应：水解反应是指复杂的有机物分子在水解酶参与下加以水分子分解为较简单化合物的反应。其中一些反应可发生在细菌体外，如蔗糖本身包含葡萄糖和果糖两部分，在水解后即分为两个分子；另一类水解反应可在微生物细胞内进行，例如化合物的碳链双键在加水后转化为单键。氧化反应：生物氧化作用主要有两类，脱氢作用和脱羧作用。