南京工程高等职业学校始建于1956年，2002年由江苏省地质矿产厅划归江苏省教育厅管辖，次年，由普通中等职业学校升格为高等职业学校，同时增挂江苏联合职业技术学院南京工程分院，是南京地区唯一一所隶属于江苏省教育厅的公办五年制高等职业学校，国家级重点职业学校。学校设有国土资源职业技能鉴定所、中国地质大学远程教育南京学习中心，是国家级建设行业技能型紧缺人才的培养培训基地，东南大学职教师资教育实习基地。

学校位于风景秀丽的钟山风景区，毗邻仙林大学城，拥有占地面积300亩，校舍近10万平方米，在校大专生5700余名，有教职员工300余名。学校设有地质工程系、建筑工程系、电子工程系、信息科学系和管理科学系五大系部共10个专业。