1、胞内酶指在细胞内起催化作用的酶，这些酶在细胞内常与颗粒体结合并有着一定的分布。如线粒体上分布着三羧酸循环酶系和氧化磷酸化酶系。

2、胞外酶指细胞内合成而在细胞外起作用的酶。包括位于细胞外表面或细胞外质空间的酶，也指释放入培养基的酶。

如人和动物的消化液中以及某些细菌所分泌的水解淀粉、脂肪和蛋白质的酶。