生理性稀便。有时较宝宝拉稀并不一定是拉肚子，有可能是因为宝宝肠道功能不健全引起的生理性即母乳性拉稀状况。

喂养不当。如果家长给宝宝喂过浓的奶粉，或者奶粉不适合，或者给宝宝喂的奶太凉，或者天气原因的，都容易引起宝宝拉稀。

奶粉过敏。有些人工喂养的宝宝有可能因为对奶粉蛋白质过敏，也会出现拉稀现象。

感冒。三个月的宝宝感冒的同时也常伴有拉稀症状，

病毒或细菌感染。三个月的宝宝拉稀也可能是细菌或病毒感染肠胃导致的，尤其是秋季常见的轮状病毒。