植物的茎是由种子中的胚芽发育而来的。

种子一般由种皮、胚和胚乳三部分组成，有的植物成熟的种子只有种皮和胚两部分；种子的胚由胚芽、胚轴、培根、子叶四部分组成，胚芽将来发育成新植物的茎和叶，胚根发育成新植物体的根，胚轴发育成连接根和茎的部位，因此胚是新植物的幼体，是种子的主要结构．

所以，植物的茎和叶是由种子中的胚芽发育而来的。