心脏神经官能症的治疗要以心理治疗为主，药物治疗为辅。

要耐心倾听病史，了解患者可能的发病原因和诱因，进行仔细的体检和必要的实验室检查，解除患者的疑虑，要通俗易懂的给患者讲解疾病性质，用一些暗示性的语言帮助患者解除顾虑，鼓励患者调整心态，安排好作息时间，适当的进行文娱体育活动。

对于有心血管危险因素的，比如高血压，高血脂，血糖异常，应该积极进行危险因素的干预。

如果患者有精神心理问题，提倡双心医学的治疗模式。