继发性高血压的病因较隐匿，可涉及心血管系统，内分泌系统，泌尿系统，睡眠医学精神，心理疾病等多个系统。其基本的病因包括肾实质性疾病，如急慢性肾小球肾炎，慢性肾盂肾炎，肾肿瘤等等。肾血管性疾病，常见肾动脉狭窄，大动脉炎，动脉粥样硬化性肾动脉疾病等等。阻塞性睡眠呼吸暂停低通气综合征，原发性醛固酮增多症，皮质醇增多症，嗜铬细胞瘤等内分泌性继发性高血压。

另外，心血管病变，颅脑病变等疾病，如主动脉关闭不全，脑肿瘤，脑外伤等均可引起继发性高血压。药物因素，如糖皮质激素，拟交感神经药物，可引起药物性高血压。