二者各有千秋，在理工类专业吉林大学较强，在经济金融类专业上海财经大学较好。

上海财经大学是中华人民共和国教育部直属的一所以经济管理学科为主，经、管、法、文、理、哲等多学科协调发展的研究型重点大学；是国家“211工程”、“985工程优势学科创新平台”重点建设高校，国家“双一流”世界一流学科建设高校；吉林大学是中华人民共和国教育部直属的综合性全国重点大学，国家“双一流”、“211工程”、“985工程”、“2011计划”重点建设的著名学府。