甲钴胺的危害有一些患者服用甲钴胺后会产生一些不良反应是偶有皮疹，停药后消退，还有食欲不振，恶心呕吐等。

甲钴胺是一种维生素B12，其结构是以钴离子为中心的大环络合物，类似血红素的结构。常温下除见光易变为羟钴胺外，其化学性质稳定，尤其与片剂中的其它辅料不发生化学反应；甲钴胺本身也十分稳定，根据它在常温避光下10年的HPLC图谱结果，其有关物质变化甚微，也就是说在没有外界影响的情况下，存放10年几乎无变化。