扎龙自然保护区保护的是禽类动物，主要是丹顶鹤。黑龙江扎龙国家级自然保护区是我国以鹤类等大型水禽为主的珍稀水禽分布区，是世界上最大的丹顶鹤繁殖地。

扎龙自然保护区界平面呈东北至西南不规则橄榄形，南北长80.6公里，东西宽58.0公里，总面积21万公顷。属湿地生态系统类型的自然保护区。保护区内拥有世界闻名的扎龙湿地，扎龙湿地为亚洲第一、世界第四，也是世界最大的芦苇湿地。1992年被列入“国际重要湿地名录”。世界上现有鹤类15种，中国有9种，扎龙有6种；全世界丹顶鹤不足2000只，扎龙有400多只。