新生儿医保卡里面是有余额的，新生儿医保属于城乡居民医保，缴纳的保费一部分会进入个人账户，一部分进入统筹账户。其中个人账户里的钱，就是医保卡内的余额。这个余额是可以用的，看门诊、药店买药、买保险等都是可以的。而统筹账户里的钱，只可以用于住院报销。

两个账户里的钱是互不影响的，即使医保卡的余额为零，也不影响住院报销。