木瓜有两种类型，一种瓜身苗条，形状大致似节瓜或蒲瓜，人称“木瓜公”，它瓜肉厚、瓜籽少、汁水多而清甜。另一种瓜身圆圆的，外形好像葫芦瓜或似沙田柚，它瓜肉薄、瓜籽多、瓜汁稍少，人称“木瓜婆”。如果欲把树上熟的新鲜木瓜作水果吃，最好选买“木瓜公”。

药用木瓜鲜果中含有较多的单宁和有机酸，糖含量相对较低，使其口感酸涩，不宜生食。但其果实营养丰富，富含维生素。木瓜中酸类成分包括苹果酸、枸橼酸、酒石酸等，这些有机酸都具有纯正的酸味，经过适当稀释并辅以一定的甜味剂如蔗糖或蜂蜜后，可制成风味独特的产品。