评价如下：

在南北宗论中，董其昌标榜的淡的艺术思想，对当时乃至后世的山水画家，具有警醒的作用。南北宗论褒南贬北，实有斥责画工画，而提醒文人画的功效，这不仅为文人画成为中国山水画之正宗，开辟了道路，而且也为明人指明了山水画平淡天真的审美性情。

他从禅宗的南顿北渐入手，影响了后世对山水画的理解。南北宗论是以禅宗的南顿北渐为喻而自圆其说的，但禅宗的衣钵相传，并不适合于山水画的传承问题，他以此为喻来建立绘画的衣钵相传的体系，实为不恰。

他的南北宗论从淡的艺术思想出发来整理绘画系统，但是却不能客观公正的来处理，只是为了标榜平淡天真。