1、五碳糖组成不同：单链DNA是脱氧核糖，RNA为核糖。

2、碱基组成不同：碱基由腺嘌呤、胸腺嘧啶、胞嘧啶、鸟嘌呤、尿嘧啶 五种组成。DNA单链没有尿嘧啶碱基，RNA没有胸腺嘧啶碱基。

3、化学性质不同：DNA单链溶于苯酚而RNA不溶，故可用苯酚来沉淀RNA。

4、组成单位不同：DNA的组成单位是脱氧核苷酸，RNA的组成单位是核糖核苷酸。

5、功能不同：DNA单链是遗传物质，RNA一般在细胞中不作为遗传物质。