基因沉寂也可以被称为“基因沉默”。基因沉寂是真核生物细胞基因表达调节的一种重要手段。 在染色体水平，基因沉寂实际上是形成异染色质的过程，被沉寂的基因区段呈高浓缩状态。

原理：基因沉寂需要经历不同的反应过程才能实现，包括组蛋白N端结构域的赖氨酸残基的去乙酰基化加工、甲基化修饰、以及和甲基化修饰的组蛋白结合的蛋白质形成“异染色质”，在上述过程中，除了部分组蛋白的N端尾部结构域需要去乙酰化、甲基化修饰之外，有时也许要在其他的组蛋白N端尾部结构域的赖氨酸或精氨酸残基上相应地进行乙酰化修饰，尽管各种修饰的最终结果会导致相应区段的基因“沉寂”失去转录活性。