昆明市的平均海拔为1500～2800m。昆明市中心海拔约1891m。拱王山马鬃岭为昆明境内最高点，海拔4247．7m，金沙江与普渡河汇合处为昆明境内最低点，海拔746m。

海拔超过3000米的部分地区有高原反应，在昆明大部分地区都不会发生高原反应。高原反应是人体急速进入海拔3000米以上高原暴露于低压低氧环境后产生的各种不适，是高原地区独有的常见病。