酵素牙膏的副作用是使用时间过长会导致牙齿的坚硬程度下降，可能会出现裂缝的情况。危害性是酵素牙膏可能会对身体的钙营养流失产生一定的影响，会加大身体的钙的流失率。

酵素是以动物、植物、菌类等为原料，添加或不添加辅料，经微生物发酵制得的含有特定生物活性成分（包括多糖类、寡糖类、蛋白质及多肽、氨基酸类、维生素类）的产品。