微山湖的形成是地壳运动、黄河决溢、人为活动共同作用的结果。

四亿年前华北地区整体下降为前海和湖沼；七百万年以后，由于地壳强烈运动，形成大面积凹陷，鲁中山西形成涝洼区，为微山湖的诞生创造了条件；黄河不断决溢的淤积抬高泗水西岸的高地，导致黄河水长期占据形成了大面积湿地；最后由于明代万历年间黄河决口，微山湖就形成了。