猪舍消毒一般使用的有氢氧化钠(烧碱)、石灰乳、漂白粉、过氧乙酸、乙醇和福尔马林。氢氧化钠(烧碱)对细菌和病毒均有强大的杀灭力；石灰乳适于粉刷墙壁、圈栏、消毒地面、沟渠和粪尿等；漂白粉用于畜舍、地面、水沟、粪便、运输工具等消毒；过氧乙酸消毒效果好，能杀死细菌、真菌、芽孢和病毒；乙醇能杀死一般细菌；来苏儿用于畜舍、护理用具、日常器械、洗手等消毒；福尔马林用做猪舍的熏蒸消毒。