借款合同中违约金条款有如下效力问题：

一、在民间借贷合同中，应当允许当事人就逾期还款约定违约金，作为承担责任的一种方式。

二、《合同法》第一百一十四条第二款规定：约定的违约金低于造成的损失的，当事人可以请求人民法院或者仲裁机构予以增加；约定的违约金过分高于造成的损失的，当事人可以请求人民法院或仲裁机构予以适当减少。