科差，亦称差科，相当于唐代的调，为一种国家收税的方式措施，以户为收税对象。

科差在南北方实行方法有所不同。 科差在北方征丝料与包银，按户征收。丝、银全科户，丝料1斤6两4钱，包银中统钞4两；减半科户丝、银都折半；止纳丝户，丝料1斤6两4钱，包银不纳。科差输纳，定有期限。中统二年规定，丝限八月，包银初限八月，中限十月，末限十二月；次年，改为丝料不超过七月，包银不能超过九月。北方科差主要用丝纳，不用谷物。因为欧亚交通发达，丝为出口的主要商品。至元世祖时行钞法，即丝为钞本，正如明后期以银为货币本位那样，元代以丝为货币本位。科差在江南纳户钞与包银。户钞定额是“于一万户田租中输百钞，准中原五户丝数，谓之江南户钞”，江南户钞相当于北方的五户丝。江南包银始于仁宗延七年，其税率为每户2两，户钞与包银都征银。