能发生碱基互补配对的细胞器有三种，分别为线粒体、叶绿体、核糖体，核糖体中包括细胞核、拟核、质粒。

细胞器，散布在细胞质内具有一定形态和功能的微结构或微器官；

碱基，指嘌呤和嘧啶的衍生物，是核酸、核苷、核苷酸的成分；

线粒体，细胞中制造能量的结构，是细胞进行有氧呼吸的主要场所；

叶绿体，植物细胞中由双层膜围成，含有叶绿素能进行光合作用的细胞器；

核糖体，旧称核糖核蛋白体或核蛋白体，细胞中的一种细胞器，除哺乳动物成熟的红细胞，植物筛管细胞外，细胞中都有核糖体存在。