在外观、水份、甜度方面有区别。成熟后的黄金百香果是金黄色的，普通的是紫色的。黄金百香果比紫色百香果果汁要多，黄金百香果果汁为45%，紫色百香果果汁为35%。金百香果的甜度是紫色百香果的5倍左右。

黄色百香果和紫色百香果的果形有区别。紫色百香果，果形较小，鸡蛋形。黄色百香果果形较大，近圆形。

繁殖方法不同：紫色百香自花授粉结果，不用人工受粉。黄色百香果，一般用来做嫁接苗枮木。

百香果的果实内有黄色果汁和黑色种子，含有蛋白质、脂肪、糖类和多种维生素及氨基酸等。