托木斯克坐落在托米河的右岸，距离托米河流入鄂毕河处50公里，距离莫斯科的直线距离为3500公里。该市通过别雷亚尔阿西诺泰加铁路与西伯利亚大铁路相连接，还是托木斯克尤尔加等公路的枢纽站。

托木斯克是一座俄罗斯城市，是与其同名的州和地区的行政中心。于1604年建城，截止到2005年底人口50.69万人，在俄联邦城市中排第32位。它是西伯利亚地区教育和科学中心，其教授密度居全国第一。2005年俄罗斯政府首批划定六个经济特区，托木斯克因其在科技领域的优势而被定为技术型经济特区。